Database voor plantpathogenen

Op 22 juni wordt een voor ieder toegankelijke database gelanceerd met de in Nederland beschikbare pathogenencollectie. Gegevens van andere (Europese) onderzoeksprojecten worden hier ook aan gekoppeld.

In 2006 is het vijfjarig plantgezondheidsprogramma van start gegaan, met behulp van gelden van het Fonds Economische Structuurversterking (FES) van de Nederlandse overheid.

Doel
Naktuinbouw is één van de deelnemende organisaties aan het programma ter verbetering van plantgezondheidsonderzoek. Het programma is van start gegaan om de wetenschappelijke kennis op het gebied van plantenziekten te versterken: de focus ligt op het in stand houden en up-to-date maken van Nederlandse collecties van plantpathogenen.

Pathogenencollectie relevant?
Waarom is een goede pathogenencollectie nu zo relevant? Voor het ontwikkelen van een nieuwe toetsmethode is het van belang om de variatie binnen het pathogeen te kennen. Daarnaast zijn populaties pathogenen aan veranderingen onderhevig en is het belangrijk dat deze variatie in een collectie terug is te vinden. Er komt ook steeds meer nadruk te liggen op moleculaire data en deze data zijn in het algemeen niet gekoppeld aan de huidige collecties. Binnen het plantgezondheidsprogramma, wordt aan deze onderwerpen gewerkt.

Inhoud collectie
De bestaande collecties zijn door de inzet van de deelnemende organisaties uitgebreid met recente vondsten en afwijkende isolaten. De verschillende karakteristieken van de isolaten zijn bepaald. Denk bijvoorbeeld aan moleculaire data van belangrijke genen die gebruikt worden voor identificatie, al dan niet reageren met een specifiek antiserum bij een virusisolaat, goede foto’s van reacties van een virus op toetsplanten, et cetera. Al deze informatie is samengebracht in een overzichtelijke database die via internet benaderbaar wordt.

Database
De database wordt officieel gelanceerd op 22 juni en is voor iedereen toegankelijk. Alle isolaten die in deze database beschreven worden, zijn in Nederland beschikbaar. Daarnaast krijgt de database een internationaal karakter en worden gegevens van andere Europese) onderzoeksprojecten hieraan gekoppeld.