Identificatie met DNA
Identiteit van plantenrassen en/of soorten wordt steeds belangrijker. Naktuinbouw biedt de mogelijkheid om de identiteit van materiaal met behulp van DNA-fingerprinttechnieken vast te stellen.
DNA
De drager van erfelijke informatie (DNA) is opgebouwd uit vier verschillende bouwstenen. De volgorde waarop deze bouwstenen zijn gerangschikt vormt ‘de code’ en is uniek voor elk individu. Gebaseerd op die code kan een DNA fingerprint (streepjescode) worden gemaakt. Voor ras- en/of soortidentificatie van zowel planten als pathogenen kunnen verschillende DNA fingerprinttechnieken worden gebruikt. Naktuinbouw maakt voornamelijk gebruikt van SSR.
Genetische verwantschap
Door te onderzoeken hoeveel de DNA-code van rassen of soorten met elkaar overeenkomt (of verschilt), wordt inzicht verkregen in de mate van genetische verwantschap (of diversiteit). Wanneer het DNA tussen monsters verschilt, spreken we over een merker of polymorfisme. Hoe meer stukjes DNA er worden onderzocht, des te beter de vergelijking en betrouwbaarder de uitspraak over genetische verwantschap. Meer informatie over identificatie met DNA kunt u lezen in Identificatie met DNA in het laboratorium.
Variety Tracer
Variety Tracer geeft inzicht in de identiteit van plantaardig materiaal. Het concept combineert morfologisch onderzoek aan de plant met informatie die ligt opgeslagen in de genetische vingerafdruk. Door de informatie van de plant te vergelijken met een set referentieplanten of -rassen kan worden vastgesteld of er sprake is van nateelt, dat er inbreuk wordt gemaakt op kwekersrecht of dat het een afgeleid ras betreft. Meer over Variety Tracer vindt u in Variety Tracer: Het speurdersconcept bij inbreukzaken.
Als u een concreet probleem heeft waarvoor DNA- en/of morfologisch vergelijkend onderzoek de oplossing zou kunnen zijn, kunt u contact opnemen met de specialisten van Naktuinbouw via het aanvraagformulier Variety Tracer. Ook voor algemene vragen kunt u daar terecht.
Pathogen Tracer
Pathogen Tracer geeft inzicht in de genetische identiteit van een ziekteverwekker. Met gebruik van moderne DNA-technieken kan van een ziekteverwekker die op de plant is aangetroffen de genetische vingerafdruk worden bepaald. Dit maakt het mogelijk de herkomst van de ziekteverwekker te traceren en vervolgens de bron van de besmetting in kaart te brengen. Door in een vroegtijdig stadium de bron van een besmetting te traceren, kan de omvang van de mogelijke schade van de ziekteverwekker beperkt blijven. Meer informatie over deze nieuwe toepassing vindt u in Track and Trace in plant disease outbreaks en zie de film hieronder.
Origin Tracer
Origin Tracer geeft inzicht in de geografische herkomst van een plant of partij. Hierbij wordt gebruik gemaakt van natuurlijke variatie in isotoopsamenstelling in verschillende gebieden. Die variatie wordt veroorzaakt door verschillen in lucht, water en bodem, maar ook door locale teeltomstandigheden. Met de verkregen informatie kan worden vastgesteld of het product inderdaad is geteeld op de plek die door de leverancier wordt geclaimd. Deze techniek wordt al toegepast in forensisch onderzoek in andere sectoren en wordt nu ook in de tuinbouwsector geïmplementeerd.
Identificatie van isolaten
De analyse van isolaten van plantpathogene bacteriën (bijvoorbeeld Cmm en Xcc) en het vergelijken van de profielen, onderling of met profielen die zijn opgeslagen in de database geeft inzicht in de genetische verwantschap tussen gevonden isolaten. De resultaten kunnen inzicht geven in het verband tussen verschillende vondsten van isolaten.
Voor de analyse worden één of meer reincultures aangeleverd, vergezeld van een Laboratorium inzendformulier. DNA wordt geïsoleerd en een analyse met 4 primercombinaties wordt uitgevoerd. De resultaten worden gerapporteerd in een verslag met daarin opgenomen het dendrogram.
Tarieven
De tarieven kunt u vinden in de tarievenlijst onder 'Identificatie onderzoek'.
